Person: Nicol, J.M.
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Nicol
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Nicol, J.M.
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- Influence of thiabendazole seed treatment on the integrated control of Heterodera filipjevi on six wheat genotypes with different levels of genetic resistance under controlled conditions(Organization of Nematologists of Tropical America, 2014) Dababat, A.A.; Pariyar, S.R.; Nicol, J.M.; Erginbas Orakci, G.; Goll, M.; Watrin, C.; Duveiller, E.; Braun, H.J.; Cabrera, J.A.; Sikora, R.A.
Publication - Association analysis of resistance to cereal cyst nematodes (Heterodera avenae) and root lesion nematodes (Pratylenchus neglectus and P. thornei) in CIMMYT advanced spring wheat lines for semi-arid conditions(Japanese Society of Breeding, 2016) Dababat, A.A.; Gomez-Becerra, H.F.; Erginbas Orakci, G.; Dreisigacker, S.; Imren, M.; Toktay, H.; Elekcioglu, I.H.; Tesfamariam Mekete; Nicol, J.M.; Ansari, O.; Ogbonnaya, F.C.To identify loci linked to nematode resistance genes, a total of 126 of CIMMYT advanced spring wheat lines adapted to semi-arid conditions were screened for resistance to Heterodera avenae, Pratylenchus neglectus, and P. thornei, of which 107 lines were genotyped with 1,310 DArT. Association of DArT markers with nematode response was analyzed using the general linear model. Results showed that 11 markers were associated with resistance to H. avenae (pathotype Ha21), 25 markers with resistance to P. neglectus, and 9 significant markers were identified to be linked with resistance to P. thornei. In this work we confirmed that chromosome 4A (~90–105 cM) can be a source of resistance to P. thornei as has been recently reported. Other significant markers were also identified on chromosomal regions where no resistant genes have been reported for both nematodes species. These novel QTL were mapped to chromosomes 5A, 6A, and 7A for H. avenae; on chromosomes 1A, 1B, 3A, 3B, 6B, 7AS, and 7D for P. neglectus; and on chromosomes 1D, 2A, and 5B for P. thornei and represent potentially new loci linked to resistance that may be useful for selecting parents and deploying resistance into elite germplasm adapted to regions where nematodes are causing problem.
Publication - Cereal Cyst Nematodes: an unnoticed threat to global cereal production(CGIAR, 2011) Dababat, A.A.; Pariyar, S.R.; Nicol, J.M.; Duveiller, E.Nematodes are among the earliest recognized parasites of wheat that occur worldwide in nearly all environments. A loss of 10% of world crop production has been estimated as a result of plant nematode damage (Whitehead 1998). The cereal cyst nematodes (CCN
Publication - Screening for resistance to Heterodera filipjevi (Madzhidov) Stelter (Tylenchida: Heteroderidae) and Pratylenchus thornei (Sher & Allen) (Tylenchida: Pratylenchidae) sister lines of spring wheat(Entomological Society Turkey, Ege University, 2012) Toktay, H.; Yavuzaslanoglu, E.; Imren, M.; Nicol, J.M.; Elekcioglu, I.H.; Dababat, A.A.Breeding for resistance to the cereal cyst nematodes (CCN) Heterodera filipjevi (Madzhidov,) Stelter, and H. avenae (Wollenweber) and to the root lesion nematode (RLN) Pratylenchus thornei (Sher & Allen) is presently being undertaken by breeding programs at research institutions in Turkey. This study was carried out to screen for nematode resistance in an advanced spring bread wheat breeding population, 42 lines (F9) developed at CIMMYT in Mexico, by crossing resistant parent the Middle- Eastern landrace AUS4930 7.2 and susceptible parent, the widely adapted, high yielding CIMMYT line, Pastor. The results demonstrate that 31 lines are resistant to P. thornei and 5 lines are resistant to H. filipjevi. Only 4 of these lines (2, 7, 23 and 41) are resistant to both nematodes. Lines 2, 7 and 41 also contain the known resistance gene, Cre1. Although some lines carry the Cre1 gene, they are susceptible to either both or one of these nematodes. There is no association among H. filipjevi, P. thornei and Cre1 resistance due to differences in the resistance region in the plant genome.
Publication - Improved methodology for resistance screening in spring wheat against the root lesion nematode, Pratylenchus thornei (Sher et Allen) (Tylenchida: Pratylenchidae)(Entomological Society Turkey, Ege University, 2012) Toktay, H.; Imren, M.; Nicol, J.M.; Dababat, A.A.; Elekcioglu, I.H.The root lesion nematode, Pratylenchus thornei (Sher et Allen) is a polyphagous and economically important nematode in wheat production systems, particularly in rainfed environments. Chemical management of this nematode is not economically or environmentally sound, leaving cultural practices like crop rotation as the most widely accepted option. Long-term control is best achieved in established wheat monoculture systems through genetic improvement, which provides both economic and environmental benefits to the growers. Intensive screening under controlled conditions can facilitate and accelerate the identification of resistance and its subsequent deployment in commercial wheat cultivars. In this study, a number of variables were assessed to optimize P. thornei screening, including initial nematode density, soil type, container size, reference cultivars, harvest time and watering regime with perlite. Growth room experiments showed clear separation between the resistant and susceptible cultivars, using sandy growth edium (70:29:1 sand, field soil and organic matter), small container (15 mm diameter x 100 mm in long), inoculation density with 400 individuals per plant, 9 week growing period and bottom perlite irrigation system.
Publication - Les nématodes des plantes: un guide pratique des techniques de terrain et de laboratoire(IITA, 2010) Quénéhervé, P.; Coyne, D.; Nicol, J.M.; Claudius-Cole, B.Ce guide se veut une référence simple et facile à suivre afin d’identifier les problèmes dus aux nématodes parasites des plantes. Il fournit des instructions claires, largement illustrées, sur les procédures de collecte, et d’extraction des nématodes, aussi bien que sur leurs identifications et le diagnostic ultérieur. Ce manuel s’adresse en priorité aux techniciens et ingénieurs de terrains et de laboratoires, à tous les professionnels intéressés par les productions agricoles et la protection des plantes, particulièrement à tous ceux qui, dans certaines parties du monde, n’ont qu’un accès limité aux aides techniques et aux laboratoires bien équipés. Il a été écrit en réponse aux fréquentes demandes de collègues pour un guide pratique d’aide au diagnostic en nématologie. Ce guide devrait, espérons le, simplifier quelques aspects de la nématologie et aider à dissiper quelques mystères liés à ces ravageurs des cultures. On entend fréquemment que les nématodes ne sont reconnus comme un problème en protection des plantes que lorsque qu’un nématologiste est présent, et que, sans la présence de ce nématologiste, il n’y aurait sans doute pas de problème. Paradoxalement les symptômes non spécifiques liés aux attaques de nématodes sont souvent attribués à diverses causes qui semblent plus ou moins évidentes. La réalité est qu’un grand nombre de contraintes se combinent sur une même culture, et il est nécessaire de quantifier toutes ces principales contraintes, sans oublier les nématodes. Toujours garder à l’esprit une éventuelle implication des nématodes, en relation avec les autres maladies et ravageurs, est un véritable defi. Un defi qui devrait bénéficier grandement d’une meilleure évaluation quantitative du problème lié aux nématodes à travers des procédures améliorées au laboratoire et lors des essais aux champs. Les nématodes parasites des plantes sont toujours présents et susceptibles d’interférer avec la croissance des plantes et la production de la culture. Les nématodes représentent des contraintes significatives en agriculture de subsistance et peuvent être difficiles à contrôler. La détermination de l’importance d’une espèce particulière de nématode, d’une communauté de nématodes ou de la combinaison des nématodes avec un autre problème n’est jamais une tâche facile et l’est encore moins en conditions tropicales. Des espèces jusqu’alors non connues pour leur pathogénicité aux cultures sont découvertes continuellement, particulièrement lors d’adaptations à de nouvelles pratiques ou lors d’introduction de nouvelles cultures. La mise en oeuvre ou l’amélioration de techniques de diagnostic ou d’analyses en nématologie peut conduire à l’identification de nématodes comme responsables d’un problème présent depuis de nombreuses années, mais qui, par manque d’expertise locale, fut mal diagnostiqué.. Beaucoup reste à apprendre à propos des nématodes et des dommages qu’ils occasionnent aux cultures. Il y a par exemple un manque évident de données fiables sur la relation entre densité de nématodes et perte de récolte pour de nombreuses cultures et pour beaucoup d’espèces de nématodes. Dans beaucoup de pays en développement, ces données de base n’existent même pas. Il est cependant important que des efforts, aussi minimes soient-ils, soient portés à l’acquisition et à l’enregistrement de ces données de base dans le futur, à travers les publications émanant de sociétés savantes et de journaux régionaux ou internationaux. Nous espérons que ce guide contribuera à une meilleure protection des végétaux, particulièrement là où l’expertise en nématologie est encore faible comme dans les pays en développement. L’étape initiale vers ce contrôle, passe par la reconnaissance des nématodes à travers une collection en relation avec les symptômes en collaboration avec un expert capable d’identifier les espèces en cause. Ce guide se veut être le support de cette première étape.
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